DNAnexus

DNAnexus bietet Life-Science-Organisationen eine Umgebung für die Arbeit mit sehr großen Datensätzen. Bei der Sequenzierung eines Genoms entstehen umfangreiche Dateien. Die Analyse von Tausenden davon erfordert erhebliche Rechenleistung und sorgfältige Datenverwaltung. Die Plattform bietet Cloud-Speicher, skalierbare Rechenleistung, Workflow-Tools und einen Katalog bioinformatischer Pipelines. So können Teams Analysen ausführen, ohne eigene Server verwalten zu müssen. Die Plattform ist auf regulatorische und datenschutzrechtliche Anforderungen für klinische Gesundheitsdaten ausgelegt.

Zusammenarbeit ist ein zentrales Merkmal. Mehrere Organisationen können Datensätze und Tools in kontrollierten Umgebungen gemeinsam nutzen; Zugriffsrichtlinien schützen dabei sensible Informationen. Die Plattform wurde in großen nationalen Forschungsprogrammen eingesetzt. Forschende analysieren Daten dort in einem sicheren Arbeitsbereich und bringen ihren Code zu den Daten, statt diese herunterzuladen. Werkzeuge zum Erstellen von Kohorten und für Analysen helfen dabei, Muster in Genom- und klinischen Daten zu finden. KI- und Machine-Learning-Workflows können auf denselben Daten ausgeführt werden.

DNAnexus wird Unternehmen, Gesundheitssystemen und Forschungsprogrammen im Rahmen individueller Verträge angeboten. Die Kosten richten sich nach Speicher- und Rechenleistungsbedarf. Um die Plattform optimal zu nutzen, ist bioinformatische Fachkenntnis erforderlich. Zu den Alternativen zählen Seven Bridges (heute Teil von Velsera), Terra vom Broad Institute und seinen Partnern, die vernetzte Software von Illumina sowie Genomikdienste von AWS, Google Cloud und Microsoft. DNAnexus eignet sich für Organisationen mit regulierter Genomikarbeit in großem Maßstab.