AlphaFold 3

AlphaFold 3 es un modelo de predicción de estructuras que Google DeepMind e Isomorphic Labs publicaron en mayo de 2024. Amplía el AlphaFold 2, limitado a proteínas, a un abanico mucho más amplio de moléculas biológicas. En lugar de predecir solo el plegamiento de proteínas, modela de forma conjunta complejos que contienen proteínas, ADN, ARN, ligandos de molécula pequeña, iones y residuos modificados químicamente, con una arquitectura rediseñada en torno a un módulo llamado Pairformer. Así, quien investiga puede preguntar cómo podría unirse una molécula candidata a fármaco a una proteína, o cómo interactúa una proteína con una hebra de ARN, en una sola predicción, en vez de combinar herramientas separadas.

DeepMind puso el modelo a disposición a través del AlphaFold Server gratuito para investigación no comercial y, en noviembre de 2024, publicó también el código y los pesos subyacentes para uso académico, aunque el uso comercial sigue pasando por Isomorphic Labs. AlphaFold 3 se usa mucho en biología estructural y en las primeras fases del descubrimiento de fármacos, y extendió el trabajo anterior de DeepMind sobre predicción de la estructura de proteínas, reconocido con el Premio Nobel, al espacio más amplio de interacciones moleculares del que dependen la mayor parte del diseño de fármacos y de la investigación de enfermedades.