Nextflow

Los pipelines se escriben como procesos conectados por canales y se ejecutan en portátiles, clústeres o servicios en la nube. Los contenedores mantienen coherentes las versiones del software. La comunidad nf-core publica pipelines probados para análisis habituales.

Seqera, la empresa que está detrás, vende herramientas alojadas. El lenguaje tiene una curva de aprendizaje para quien empieza con flujos de trabajo.

Snakemake y Galaxy son alternativas. Nextflow sirve a bioinformáticos que ejecutan pipelines a gran escala.