SnapGene

SnapGene ofrece a los biólogos moleculares una forma visual y fiable de planificar el trabajo con ADN. Los investigadores abren o crean secuencias de plásmidos y ADN, ven anotados automáticamente elementos como genes y promotores, y simulan pasos de clonación como digestiones de restricción, ligaciones, ensamblaje Gibson y clonación Gateway antes de pasar al laboratorio. La herramienta muestra los mapas y las secuencias resultantes, lo que ayuda a evitar errores costosos.

Tiene una gran biblioteca de vectores y elementos estándar, herramientas para diseñar cebadores y un visor que permite a los colaboradores abrir archivos sin licencia. La comparación de secuencias, los alineamientos y la posibilidad de importar desde bases de datos apoyan las tareas diarias del laboratorio. Los archivos se comparten en un formato muy extendido en el campo. Una versión de servidor permite bibliotecas de equipo.

SnapGene es de pago, con licencias para particulares e instituciones, y un visor gratuito. Forma parte de Dotmatics, que fabrica otro software científico. La IA no es su función central, aunque los enfoques de aprendizaje automático se van abriendo paso en el diseño de secuencias y en las herramientas de proteínas en general. Entre las alternativas están Benchling para la colaboración en la nube, Geneious para un análisis de secuencias más amplio, las herramientas gratuitas de Addgene, y SerialCloner y ApE como opciones gratuitas. SnapGene le va bien a los biólogos de laboratorio que hacen clonación.