DNAnexus

DNAnexus donne aux organisations des sciences de la vie un endroit pour travailler sur de très grands jeux de données. Séquencer un génome produit des fichiers énormes, et en analyser des milliers demande beaucoup de calcul et une gestion soigneuse des données. La plateforme fournit du stockage cloud, du calcul qui monte en charge, des outils de flux de travail et un catalogue de pipelines de bio-informatique, pour que les équipes lancent des analyses sans gérer leurs propres serveurs. Elle est construite pour répondre aux exigences réglementaires et de confidentialité des données cliniques et de santé.

La collaboration est un trait distinctif. Plusieurs organisations peuvent partager des jeux de données et des outils dans des environnements contrôlés, tandis que les politiques d’accès protègent les informations sensibles. La plateforme a servi à de grands programmes nationaux de recherche, où les chercheurs analysent les données dans un espace de travail sécurisé et apportent leur code aux données au lieu de les télécharger. Des outils de construction de cohortes et d’analyse aident à trouver des motifs dans les informations génomiques et cliniques, et des flux d’IA et de machine learning peuvent tourner sur les mêmes données.

DNAnexus se vend aux entreprises, aux systèmes de santé et aux programmes de recherche sous contrats sur mesure, avec des coûts liés au stockage et au calcul. Il faut une expertise en bio-informatique pour en tirer le meilleur. Les concurrents et alternatives incluent Seven Bridges (désormais dans Velsera), Terra du Broad Institute et de ses partenaires, les logiciels connectés d’Illumina, et les services de génomique d’AWS, Google Cloud et Microsoft. Ça convient aux organisations qui ont un travail génomique réglementé et à grande échelle.