RoseTTAFoldは、アミノ酸の鎖がどのように折りたたまれて3次元のタンパク質になるかを予測します。タンパク質の形がわかると、その働きや、薬でどう狙うかを科学者が理解しやすくなります。このモデルはワシントン大学のInstitute for Protein Designで開発され、AlphaFoldとほぼ同じ時期に登場し、3トラックのニューラルネットワークで同等の手法を示しました。
この取り組みはファミリーに広がっています。RoseTTAFold All-Atomは、低分子、DNAなどを含む複合体をモデル化します。RFdiffusionは、バインダーや酵素といった設計課題向けに、新しいタンパク質の骨格を生成します。これらのツールにより、既存のタンパク質の予測から新しいタンパク質の創出へと関心が移りつつあり、医療や材料への応用が見込まれています。
コードとモデルは、GitHubとウェブサーバー経由で研究用に公開されています。ライセンスの詳細はリリースによって異なります。予測は実験で確かめる必要があり、モデルを動かすには計算資源と専門知識が要ります。代替にはAlphaFold、ESMFold、OpenFold、Boltz、Chaiがあります。RoseTTAFoldは、構造生物学者やタンパク質の設計者に向いています。